Изначально сценарий назывался «Баланс силы» и был написан дебютанткой Деборой Дэвис в 1998 году, но тексту пришлось ждать своего часа двадцать лет, потому что тогда продюсеры скептически отнеслись к историческому сюжету про женский любовный треугольник без ключевых мужских ролей. Лантимос подключился к проекту после успеха «Клыка», но попросил телевизионного сценариста Тони МакНамару обновить сценарий, выкинув оттуда исторические подробности про политику.

Сначала на главную роль утвердили Кейт Уинслет, но впоследствии её сменила Рэйчел Вайс.

Фильм снимался в усадьбе Хэтфилд-хаус, где часто проводят съемки. Например, там же жил Брюс Уэйн в «Бэтмене» и «Бэтмене: Начало». Это был дом Гетти в фильме «Все деньги мира» и сериале «Траст». Узнаваемые интерьеры «Фаворитки» можно увидеть в клипе Робби Уилльямса «Party Like a Russian».

Фильм снимался на пленку при естественном освещении, лишь в сцене танцев к свечам добавили немного дополнительного света.

Чтобы отточить британский акцент, американка Эмма Стоун разговаривала с ним в общественных местах, до тех пор пока даже англичанка Рэйчел Вайс не признала ее акцент более аутентичным, чем у нее самой. Больше всего Стоун нравится в сценарии матерное слово cunt, которое в американской культуре считается очень неприличным, а в Британии прижилось гораздо лучше.

Лантимос и художники-постановщики фильма позволили себе множество анахронизмов в кадре — например, специальное кресло-каталку для королевы, каких не было в то время.

Считается, что главная роль принадлежит Оливии Колман, но это лишь бюрократическая проволочка. Сюжет прописан так, чтобы каждая героиня постепенно выходила на первый план. Однако по правилам «Оскара» от фильма следует выдвигать только одну актрису на номинацию «Лучшая женская роль». Так как Колман получила актерский приз на Венецианском кинофестивале, было принято решение выдвинуть именно ее, а Эмму Стоун и Рэйчел Вайс отправить в номинацию второго плана. В итоге «Фаворитка» стала вторым (после «Цветы лиловые полей») фильмом в истории с 10 номинациями на «Оскар», где номинированы сразу три актрисы и ни одного актера.

Абигейль поступила в службу королевы Анны Стюарт в 1704 году, но муж королевы Анны — принц Георг Датский, умерший в 1708 году — в фильме не упоминается. Его смерть, как и смерть их детей, была одной из причин депрессии Анны.

Оливия Колман набрала около 16 килограмм для роли королевы Анны Стюарт.